【{$randkws}】遗传学研究揭示日本珍珠牡蛎背后的“分子指纹” - {$web_name} 由于它们能生产出美丽的珍珠

遗传学探究揭示日本珍珠牡蛎背后的“分子指纹”
（神秘的地球uux.cn）据cnBeta：在日本，珍珠牡蛎是一种重大的水产养殖动物，由于它们能生产出美丽的珍珠，被用来制作项链、耳环和戒指。在20世纪90年代初，刚刚本周综艺看点，细节曝光引关注这个水产养殖业每年带来大约880亿日元的收益。但是，在过去的20年里，由于新的疾病和赤潮的联兴办用下，日本的珍珠产量从每年约70000公斤下降到只有20000公斤。
如今，独家演员阵容解读探究人员已然兴办了一个高品质的、染色体规模的珍珠牡蛎基因组，他们期盼可以用它来寻找有弹性的品系。这项探究是由冲绳科学与技术探究所（OIST）的科学家与其他一些探究机构兴办开展的，含有K. MIKIMOTO & CO., LTD、珍珠探究所和日本水产探究与教学机构，最近发表在DNA探究杂志上。
"兴办基因组是相当重大的，"两位第一作者之一，OIST海洋基因组学部门的岗位人员科学家竹内嵩博士说。"基因组是回顾国产电影快报一个生物体的全套基因--其中许多是生存所必需的。有了完整的基因序列，我们可以做许多评测，并回答围绕免疫和珍珠如何形成的难题。"
2012年，竹内博士和他的兴办者发表了日本珍珠牡蛎（Pinctada fucata）的基因组草案，这是第一批组装的软体动物基因组之一。他们持续开展基因组测序，以兴办一个更高品质的、染色体规模的基因组装配。
牡蛎的基因组由14对染色体组成，从双亲双方各继承了一套。全面何炅汇总每对染色体的两条染色体携带差不多一样的基因，但假如多样化的基因组合有利于它们的生存，就会有细微的差别。
传统上，当一个基因组被测序时，探究人员将这对染色体合并在一起。这对评测室动物很有效，由于它们的一对染色体之间通常有差不多一样的遗传信息。但是针对野生动物来说，一对染色体之间存在相当数量的基因变异，这种方法会导致信息的损失。
在这项探究中，探究人员确定在对基因组测序时不合并染色体。相反，他们对两套染色体开展了测序--这是一种相当不普遍的方法。事实上，这或许是第一个专注于海洋无脊椎动物的探究，使用这种方法。
由于珍珠牡蛎有14对染色体，所以它们总共有28条，OIST的探究人员藤江学和真弓川滿使用最先进的技术对基因组开展了排序。另一位第一作者，前OIST生态和进化基因组学算力的博士后学者、现任职于东京大学的铃木义彦博士和竹内博士重建了所有28条染色体，并察觉了一对染色体--第9对染色体之间的核心差异。值得注意的是，这些基因中有许多都与免疫力有关。
"一对染色体上的各异基因是一个重大的察觉，由于这些蛋白质可以确认各异类型的传染病，"竹内博士说。
他强调，当动物被养殖时，往往有一个品系有更高的存活率或形成更漂亮的珍珠。养殖者往往用这种品系繁殖两只动物，但这导致了近亲繁殖，缩减了遗传多样性。探究人员察觉，在连续三个近亲繁殖周期后，遗传多样性显著缩减。假如这种多样性缩减发生在与免疫力有关的基因的染色体区域，就会作用动物的免疫力。所以，维持水产养殖种群的基因组多样性是很重大的。
这项探究得到了生物导向技术探究合作机构项目的资助，这是一个有关下一代技术先进探究和开发的尤其打算项目。
渡边修吾教授（北里大学客座教授，东京大学名誉教授）的留言：
130年前，日本的御木本幸吉在全球范围内首次开发了养殖珍珠。即使在今日，它们依然是日本生产的第二大出口海商品，仅次于扇贝。
但是，日本珍珠养殖的历史一直是与养殖生态中的疾病作斗争。1996年呈现的红色变色病导致的损害尤其严重。日本的养殖珍珠的产量已然显著下降。近年来，由于病毒引发的疾病的研究，珍珠养殖业再次面临重大难题。
尽管疾病的缘由和对策的详情尚未确定，但有学者强调，日本的珍珠养殖业或许由于近亲繁殖具有优良性状的珍珠牡蛎而导致基因退化，从而难以应对各类生态转变和病原体的呈现。
这项探究的结局揭示了日本珍珠养殖的这一隐忧，并具有重大的工业价值。另外，许多参与免疫操控系统的基因也已被确定。这也为珍珠形成之谜本身提供了启示，即为什么珍珠牡蛎可以形成珍珠层以应对外部引入的异物。
由日本珍珠牡蛎生产的Akoya珍珠以其独特和优雅的光泽吸引了来自全球各地的人们，这在其他珍珠牡蛎品种生产的珍珠中是看不到的。本探究有望变成对这一特性开展遗传阐释的着手。